生物学院讲座预告

报告人：张鹏 助理教授 美国马里兰大学医学院

报告日期：2020年12月14日 上午9：30

报告标题：免疫细胞图谱计划

报告地点：生物学院科研楼B111

报告人简介：

张鹏博士，现任美国马里兰大学医学院助理教授，生物信息课题负责人，人类病毒研究所生物信息平台主任。张鹏博士2015年毕业于中国科学院生物物理研究所，获得生物信息学博士学位。同年任职于美国国家儿童医学中心，从事博士后研究所工作。2018年在马里兰大学医学院人类病毒研究所担任副研究员，2020年起开展独立课题工作，任助理教授和生物信息平台主任。张鹏课题组致力于整合测序技术，医学影像技术，以及生物信息和机器学习算法，开展“免疫细胞图谱计划"（Single Cell Atlas of Immunity)以及 “智能医疗影像诊断”(AI in Medical Imaging)等科研项目.相关研究成果发表于Nature, Nature Material, Cell Research, Cancer Research, Briefings in Bioinformatics等国际权威杂志并申请美国专利多项。

担任IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine会议学术委员会成员，以及PNAS，Briefings in Bioinformatics Oncoimmunology Journal of Molecular Cell Biology等杂志审稿人

报告摘要：

免疫系统是机体内各种细胞之间相互联系、相互制约所构成的对立统一整体，而免疫细胞图谱计划旨在全面解码人体所有免疫细胞的位置、类型、相互关联和分子组成等，建成人体发育、生理、和病理状态下的的精细免疫网络。目前该项目聚焦肿瘤免疫微环境，揭示细胞水平上肿瘤发生过程、微环境和对药物响应中的系统变化，以推进癌症免疫治疗和靶向治疗的发展。首先，我们利用单细胞转录组测序，免疫组库TCR\BCR测序，以及质谱成像（Mass Spectrometry Imaging）等技术来研究肿瘤微环境，特别是浸润肿瘤免疫细胞的功能状态和空间组成，构建免疫细胞基因表达和等高维数学特性的精细图谱。

第二，我们将数据挖掘和机器学习算法应用到癌症免疫组学大数据中，以揭示癌症的亚型、驱动基因以及其他致癌因素的遗传基础，并整合药物作用下免疫环境异质性对癌细胞的功能和药敏的影响，从而发现新型癌症靶点和免疫治疗标记物。

第三，我们开发原创性的生物信息学工具和整合性的医学数据平台来进行单细胞基因组数据和大规模癌症基因组学数据的分析、整合和可视化，为对这些数据的有效挖掘提供基础。