华中科技大学宁康教授到访生物学院
近日华中科技大学生物信息学专家宁康教授应邀来我院生物信息中心进行学术交流,并做题为“微生物组大数据挖掘研究:数据挖掘技术与临床应用” 的精彩学术报告。
微生物组学的研究对象包括所研究微生物群落内的全部遗传物质、代谢物和环境因素等所有组学相关信息,是涉及到微生物遗传学、微生物分类学、各类组学的大数据挖掘与统计分析、实验科学与技术等的交叉学科,其深入研究将能够解决微生物群落相关的一系列基础与应用问题。随着人类对于广泛分布于环境和人体中的微生物群落的认识日益加深,相关微生物组学数据的积累也与日俱增,其中必然蕴含着巨量尚未发掘的遗传资源和深刻的生态与进化规律。然而,目前的微生物组数据整合与挖掘方面的技术和方法,尚不能够满足研究人员对基因资源挖掘和模式识别的深入研究需求。
宁教授从生物大数据和人工智能的时代背景出发,首先给我们阐述了微生物组大数据相关的重要生物学问题,为我们揭开了肠道微生物广阔的研究前景和挑战,随后介绍了微生物组学大数据相关的技术方法,并特别给大家展示了宁教授负责开发的“生命科学大数据高性能计算平台”,其整合了丰富的大数据分析方法,给老师和同学们提供了一个良好的数据分析途径,最后宁教授介绍了这些方法和技术在临床和环境中的应用,特别是从海洋微生物组中挖掘新的蛋白家族以及从肠道菌群的角度解释“水土不服”等日常生活中问题的研究。
宁教授的精彩报告引起了在座师生的强烈兴趣与热烈讨论,郑何平老师就新蛋白质家族挖掘的具体细节和宁教授进行了深刻探讨,同学们则向宁教授请教了如何解决测序数据分析中的批次效应以及现今肠道细菌组研究完整度等问题,宁教授都进行了细致耐心的解答。最后主持人彭友松副教授对宁教授给予了诚挚的感谢,报告在热烈的掌声中完美落幕。
报告人简介:
宁康教授,华中科技大学生命科学与技术学院博士生导师,生物信息与系统生物学系系主任,华中卓越学者特聘教授,湖北省楚天学者特聘教授。研究重点方向为生物大数据和微生物组的挖掘及其在健康与环境等领域的应用。在华中科技大学生命科学与技术学院建立生物信息与系统生物学系,建立了“生命科学大数据高性能计算平台”、“华中科技大学鄂州工业技术研究院生物大数据中心”等多个中心和平台。已在Gut、Genome Biology、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics、Nucleic Acids Research、PLoS Genetics、Plant Cell等生物学、医学和生物信息学顶级学术期刊发表学术论文50余篇,其中以第一作者或通讯作者发表SCI论文40余篇,文章总引用超过2000次,H指数26(Google Scholar);担任Genomics Proteomics Bioinformatics、Scientific Reports等国际期刊编委;担任中国生物工程学会-计算生物学与生物信息学专业,中国计算机协会-生物信息学专业等多个生物信息学协(学)会专委委员,以及担任英国生物技术与生物科学研究理事会(UK-BBSRC)等基金评委等。
供稿人:傅萍